Aminoacizii liberi, cu exceptia prolinei, au reactivitati chimice similare, datorate prezentei in molecula a celor doua grupari functionale, gruparea carboxil si amino. Reactivitatea datorata restului legat de carbonul a va fi determinata, bine-nteles, de gruparile existe pe acesta. In consecinta reactivitatea chimica a unui anume aminoacid va fi definita de intreaga structura, fapt care se va reflecta in comportamentul biochimic al diferitelor proteine in care acesti aminoacizi sunt intalniti.